Lektori põhiülesandeks on loengute pidamine ning seminaride, praktikumide ja harjutustundide läbiviimine kõrghariduse kahes esimeses astmes. Ta korraldab õppetööd oma aines ning, kui selle aine õpetamisele on kaasatud teisi õppejõude, juhendab neid. Lektori ülesandeks on põhiõppe üliõpilaste, sealhulgas avatud ülikoolis õppijate juhendamine.
Lektor osaleb osakonna teadustöös (enamasti professori, dotsendi või vanemteaduri juhendamisel). Valimisperioodi jooksul peab ta tegema teadustööd vähemalt 2/3 doktoritöö mahus. Struktuuriüksuse juhi ettepanekul võib tema teadustöö kohustust vähendada õppetöö koormuse tõstmise arvel. Vastav kokkulepe vormistatakse kirjalikult ja lisatakse lektori töölepingule. Kui auditoorse õppetöö koormus on 480 tundi aastas või üle selle, siis lektorilt teadustööd ei nõuta.